JBK perustettiin Pedersöre Café-kahvilassa 14 joulukuuta 1944 pidetyssä kokouksessa. Kutsua olivat noudattaneet 28 innokasta nuorta, mutta näistä 8 oli liian nuoria osallistuakseen seuran perustamiseen. Kokouksen puheenjohtajaksi valittiin L.Ström ja sihteeriksi K.Backlund. Osallistujat päättivät perustaa kaupunkiin uuden jalkapalloseuran, jonka nimeksi tuli Jakobstads Bollklubb.
Seuran ensimmäinen virallinen ottelu pelattiin 10.5.1945 NIK:ta vastaan Uudessakaarlepyyssä. Joukkueen kapteeni Lasse Hellund sai kunnian tehdä seuran ensimmäisen maalin, lopputuloksen ollessa JBK:n voitto maalein 3-1, kun myöskin Åke Sandström:in 2 maalia merkittiin maalintekijätilastoon.
1948 Suomisarja (toiseksi korkein sarjataso)
1950 Suomisarja
1952 - 1965 Suomisarja
*1954 Toinen sija
*1964 Toinen sija
1966 - 1972 III ja IV divisioonat
1973 - 1975 II divisioona
1977 - 1978 II divisioona
1979 - 1997 III ja IV divisioonat
1999 - II divisioona
*2000 Toinen sija (karsinta ykköseen)
*2001 Helmikuussa jatkokarsinta (sijoitus kolmas)
Ammattilaispelaajat: Olof Sandsund, Vesa Mars